MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 90

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187119	AC	3	6	5	10	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NT_187119	CA	3	6	39	44	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NT_187119	GTAC	2	8	69	76	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NT_187119	GTCA	2	8	152	159	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NT_187119	GGA	2	6	175	180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NT_187119	C	6	6	185	190	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7	NT_187119	CG	3	6	277	282	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NT_187119	AC	3	6	304	309	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NT_187119	CTC	2	6	330	335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NT_187119	TCGC	2	8	341	348	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NT_187119	TCA	2	6	623	628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NT_187119	GA	3	6	646	651	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NT_187119	AAC	2	6	658	663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NT_187119	GTT	2	6	668	673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NT_187119	CCG	2	6	821	826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NT_187119	TCA	2	6	905	910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NT_187119	TG	3	6	918	923	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NT_187119	TAAGG	2	10	946	955	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NT_187119	CTAC	2	8	1051	1058	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NT_187119	GT	3	6	1094	1099	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NT_187119	ACG	2	6	1195	1200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NT_187119	GT	3	6	1263	1268	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NT_187119	ATG	2	6	1288	1293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NT_187119	TCC	2	6	1314	1319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NT_187119	CAA	2	6	1366	1371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NT_187119	GAC	2	6	1427	1432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NT_187119	GCA	2	6	1439	1444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NT_187119	TTC	2	6	1515	1520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NT_187119	GCC	2	6	1758	1763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30	NT_187119	TCC	2	6	1778	1783	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NT_187119	C	6	6	1822	1827	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
32	NT_187119	TGCG	2	8	1910	1917	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NT_187119	GCT	2	6	1968	1973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NT_187119	CTT	2	6	1993	1998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NT_187119	TTA	2	6	2024	2029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NT_187119	TCC	2	6	2042	2047	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NT_187119	CTT	2	6	2077	2082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NT_187119	CTG	2	6	2136	2141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NT_187119	TCG	2	6	2211	2216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NT_187119	CAA	2	6	2239	2244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NT_187119	AGT	2	6	2336	2341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NT_187119	AGC	2	6	2402	2407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NT_187119	GCT	2	6	2410	2415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NT_187119	GCC	2	6	2450	2455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NT_187119	CA	3	6	2604	2609	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NT_187119	ACCG	2	8	2732	2739	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NT_187119	TG	3	6	2746	2751	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NT_187119	CCG	2	6	2765	2770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49	NT_187119	T	7	7	2801	2807	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NT_187119	T	6	6	2817	2822	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NT_187119	T	7	7	2828	2834	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NT_187119	TGTT	2	8	2836	2843	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NT_187119	T	6	6	2886	2891	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NT_187119	ATG	2	6	2953	2958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NT_187119	GCA	2	6	5704	5709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NT_187119	TCCC	2	8	7294	7301	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
57	NT_187119	TAA	2	6	7381	7386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NT_187119	TTTTA	2	10	8930	8939	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NT_187119	TTTA	2	8	11670	11677	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NT_187119	ATTT	2	8	11688	11695	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NT_187119	A	6	6	12207	12212	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NT_187119	ACTT	2	8	12216	12223	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NT_187119	T	7	7	12298	12304	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NT_187119	CCG	2	6	12434	12439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NT_187119	ATT	2	6	13288	13293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NT_187119	AGG	2	6	13311	13316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NT_187119	A	7	7	13321	13327	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NT_187119	CCG	2	6	13329	13334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69	NT_187119	T	7	7	13342	13348	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NT_187119	TAC	2	6	13353	13358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NT_187119	CT	3	6	14782	14787	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NT_187119	TTTC	2	8	15422	15429	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NT_187119	CTA	2	6	16227	16232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NT_187119	GTAC	2	8	16241	16248	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NT_187119	TGGC	2	8	16308	16315	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
76	NT_187119	A	6	6	16358	16363	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NT_187119	TAC	2	6	21187	21192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NT_187119	ACT	3	9	21917	21925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NT_187119	A	7	7	21948	21954	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NT_187119	A	6	6	22005	22010	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NT_187119	TCC	2	6	23983	23988	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NT_187119	CTC	2	6	25117	25122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NT_187119	ATT	2	6	27031	27036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NT_187119	CTC	2	6	27056	27061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NT_187119	TGTCGC	2	12	27339	27350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NT_187119	CT	3	6	28357	28362	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NT_187119	A	8	8	28391	28398	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NT_187119	AATA	2	8	28704	28711	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NT_187119	CAA	2	6	28733	28738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NT_187119	TTCAA	2	10	28760	28769	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.